En 1940, plus de 90 000 soldats des troupes mussoliniennes et nazies occupent la Corse. C'est sur le sol de l'île que le terme "maquis" commence à désigner la Résistance. La Corse fournira à la Résistance quelques grandes figures comme Danielle Casanova, Fred Scamaroni et Jean Nicoli.

En 1942, le sous-marin Casabianca, sous les ordres du commandant l'Herminier, débarque armes et matériel sur la plage d'Arone, près de Piana.

Le soulèvement de la population contre les italiens, l'année suivante, fera de la Corse le premier département français libéré. En effet, armés, ce sont 12 000 corses qui ont participé aux combats pour la libération de l'île et beaucoup en furent victime.

La plupart des héros de la Résistance seront torturés ou exécutés par les fascistes.
Ces faits d'armes ne suffiront cependant pas à réconcilier totalement la Corse et la France, de nombreux mouvements nationaliste verront le jour quelques années plus tard.